V pokračovaní úspešného filmu Cesta do stredu Zeme začína nové rodinné 3D dobrodružstvo. Mladý Sean prijme tiesňové volanie zo záhadného ostrova, z miest, kde by sa žiadny ostrov nemal nachádzať. Je to miesto, kde existujú zvláštne formy života, hory zo zlata, životu nebezpečné sopky a ďalšie tajomstvá. Nevlastný otec nie je schopný syna zadržať, a tak sa s ním vydá na spoločnú výpravu. Spolu s pilotom helikoptéry a jeho dcérou idú hľadať ostrov, zachrániť jeho opustených obyvateľov a zároveň uniknúť seizmickým vlnám, ktoré tlačia ostrov pod morskú hladinu.